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Le Haut-Doubs est divisé en deux bassins versant distincts, celui du Doubs et du Drugeon. S'ils sont très différents en question d'habitats, on retrouve deux peuplements piscicoles proches dans le Doubs et le Drugeon. Ces deux cours d'eau sont intéressants car malgrés les interventions humaines, ils connaissent une population proche de l'écosystème "naturel".
Voici les poissons rencontrés à partir de la source des deux rivières que l'on retrouvera tout le long des secteurs avals:
La truite est, pour beaucoup de français, le poisson le plus emblématique de nos rivières. Pourtant le phénomène est amplifié par chez nous car une sous-espèce rustique de truite fario fait la fierté des "imbéciles heureux qui sont nés quelque par" dans le Doubs. Non, je plaisante, je fais partie de ces pêcheurs fiers de "leurs" rivières et je suis en admiration à chaque fois qu'une belle zébrée se laisse prendre à mes subterfuges. Zébrée ou non madame fario fréquente la quasi-totalité des cours d'eau du Haut-Doubs.
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La proie intime de la truite. On ne saurais dire qui suit l'autre, mais une chose est sûre ils sont inséparables.
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Plus discrète que ses deux voisins précédemment présentés, la loche n'en n'est pas moins omniprésente dans les cours d'eau. Elle passe sa vie sous les pierres, dans les herbes, en bref elle se planque. Car à l'instar du vairon, la loche est très appréciée par la gente salmonicole.
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Je vais faire l'inventaire des espèces présentes des lacs St-Point et Rémoray à Pontarlier car il s'agit d'un secteur représentatif, on retrouve d'ailleurs les mêmes espèces sur le Drugeon après le lac de Bouverans.
Notre deuxième zébrée favorite, la perche est très présente à partir du lac St-Point d'où elle dévale, le nanisme n'est observé que sur le lac lui même car la moyenne de taille sur le Doubs et d'environs 15cm, malgré tout de beaux spécimens sont présents partout et il n'est pas rare de les rencontrer en pêchant le brochet sur le lac ou en traquant la truite dans le Doubs. Elle se fait plus discrète dans le Drugeon mais de belles surprises restent possibles.
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Le requin d'eau douce est bien entendu présent dans les abysses du Lac St-Point. Et bien qu'étant parfois perçu comme un exterminateur de truitelles, messire esox ne dédaigne pas rejoindre les eaux courantes du Doubs. Ainsi on retrouve le brochet à partir du lac dans des secteurs dits "à truites". Le Drugeon lui abrite une population d'ésocidé surprenante vis à vis de la taille de la rivière. La maille y est d'ailleurs imposée pour protéger les nombreux "sifflets" et des brochets de plus d'un mètre se font prendre régulièrement.
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Les lacs alimentent le Doubs et le Drugeon en poissons blancs dans des proportions particulières. En effets les eaux froides ont favorisées le développement d'une population cyprinicole peu fréquente: chevesne, tanche, gardon, et goujon. L'absence d'espèces concurrentes favorise le nombre et la taille de ces poissons.
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Il faut toujours une exception à la règle celui-ci est l'intrus parmi les autres espèces. Seul poisson acclimaté avec succès, il se cantonne aux eaux lacustres et reste anecdotique dans la rivières où ce salmonidé ne fait que dévaler. Le record de France a été pêché plusieurs fois dans le lac de Rémoray.
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